Для периодического (в заданное время) проведения анализа защищенности существует возможность запуска системы System Security Scanner? по расписанию. Для этого можно использовать утилита CRON. При помощи данной утилиты администратор может не только запускать систему S3 для проведения локального или удаленного сканирования, но и создавать отчеты по результатам сканирования.

Для ОС Windows NT задание графика запуска осуществляется из графического интерфейса системы S3.